好的高度定向热解石墨 (HOPG)的STM图上您将看到由白色、灰色和黑点组成的图案。石墨 STM 图的正确解读是: 亮点意味着较高的隧道电流，暗点意味着较低的隧道电流。
从石墨的晶格模型中可以看到,石墨晶格中有两种不同的碳原子位置(见R.C.Tatar等人,Phys Rev B 25 (1982) 4126)。
一种在下面的晶格上有相邻原子(灰色),一种在下面的晶格没有邻居(白色)。因此,石墨表面的导电性有轻微变化(不同的电子密度状态),使没有邻居的原子显得"高于"其他原子(例如,I.P. Batra等人 Surf Sci 181 (1987) 126)。这还会导致浅色"小丘"之间的 HOPG 晶格常数0.25nm高于石墨晶格中最近的相邻距离值0.14nm。